古代ギリシャ科学を直接に継承したのは、イスラームを基礎とし、アラビア語を共通言語として成立している世界であり、地中海の広大な地域であった。この科学は一般に「イスラーム科学」もしくは「アラビア科学」と呼ばれている。このイスラーム科学は9世紀から16世紀まで栄え、世界の科学をリードしもした。
インド数字による計算法（今日の算用数字による計算法の起源）、Al-jabrアルジャブルという未知数を使った計算理論が、フワーリズミーによって数学理論に加えられた（これは現在の代数学（英Aljebra）へとつながるものである）。自然を実践的・実験的に操作する学問としてAl kimiya（英Alchemy）が重視されていた（現在日本語では「錬金術」などと呼ばれ、今日の化学の源流となったものである）。イスラーム科学には研究センターが存在しており、バクダードにバイト・アル・ヒクマ（知恵の館）があった。
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scientiaないしscienceという用語は、17世紀当時でもきわめて広義に用いられていたので、今日的な意味での「近代自然科学」の意味で使う人が現れた時期がいつなのか探るのは困難であり、せいぜい、精密自然科学が成立したのと同時というほかはない、という。
20世紀の歴史学者ハーバート・バターフィールドは、17世紀のヨーロッパにおいて、自然現象を単に眺めて考察するという状態から一歩進んで、自然法則が作用する環境をさまざまな撹乱要因を取り除いて人為的に作り出す試み、すなわち実験（冒険）という手法を採用して、実証的に知識体系を進歩させていくという知的営為が形成されたとした。